Ход мыслей у нас одинаковый, как раз сейчас собрал xdelta3 для Linux/ARM - под ним все пропатчилось отлично!
У меня какой-то патч не вставал, даже через онлайн патчеры, и пришлось новую хдельту качать, но так как я использую UI, я заменил файл в папке. И потом просто забыл обратно откатить, когда сам делал патчи.
Мегаманы на ips, а Ren Adventures я обновлял пару дней назад (исправил запуск на некоторых эмулях), и как раз это и заметил, поэтому с ним и нет проблем. Так что с компрессией это не связано, а с версией.
Мегаман 1 тоже обновлён, но вероятно будет ещё 1 будет апдейт.
Но нафига они формат сменили это конечно вопрос.