Ну ой ли, господа эксперты!
Не стоит забывать о примитивной программе Movie Maker уже встроенной в Windows ME и Windows XP.
Только что для примера запустил её, взял первый кусок для импорта в сборники - avi в DivX с разрешением 640х480, перетащил клип на раскадровку внизу и второй кусок - avi в Indeo® Video 5 с 384х288 - туда же соответственно. Сохраняю файл фильма с битрейтом и разрешением которые выбираю сам и - вуаля! Склеены воедино два куска разных форматов без особых трудностей. Одно лишь скажу - Муви Мейкер понимает не все форматы видео, иногда специально для него надо конвертить видео в какой-нибудь удобоваримый формат, ну и сохранять из-под него можно только в wmv.
Тему, соответственно, пока открою...