Скажи характеристики своего компьютера.
Возможно, слабый процессор. Если двухядерный, то это еще ничего не значит (если, к примеру, у человека двухядерный на 1.8 ГГЦ, то NO$GBA будет идти хреново, так как он не поддерживает и не будет поддерживать мультиядерные процессоры)...
Еще: отключи все программы, которые могут хоть маленько грузить процессор. Если идет дефрагментация\очиска\тд диска, на котором находится ром, то отключи, так как любая нагрузка на жесткий диск с ромами повергает эмулятор в это "дерганое" состояние. Если установлен\включен Download Master, то отключи его, так как него есть тупая мода периодически, совершенно просто так, в состоянии простоя, грузить процессоры на 30-40% (то есть периодически нормально-грузит-нормально-грузит через каждые 2-3 минуты)...