Если делать скриншоты при отключенной фильтрации и размере 1.0 окна эмулятора
при этом сохраняя NES и SMD в 256 цветный *.gif со сжатием - потерь не будет тк
в этих консолях менее 256 цветов одновременно на экране. Кроме случаев
применения растровых эффектов (тогда цветов может быть намного больше, но это отдельная тема).
SNES же выводит 256 цветов одновременно обычно, но имеет особый альфа канал для
спец эффектов (прозрачность) - так что цветов может быть больше.
Сохраняйте в формат *.png - это развитие формата *.gif.
Изображения полноценные - 24 бита на точку, 8 бит на компоненту. Непалитровое.
Потерь нет, а сжатие довольно сильное. Зависит напрямую от изображения.