Переустановка была с преформаттингом? Имеется в виду, ты делал после вирусов формат всех жестких, флешек, и уничтожение дисков, записанных до форматирования.
Если формат был, ты не полузуешься флэхами и самозаписанными компактами - все будет ОК. Если же ты не форматировал, есть возможность что вирусы остались. Кстати посоветую инструмент Dr. Web CureIt! Он лечит зараженные файлы (не удаляет, как правило, а сначала пытается убрать вирусный код.) А также видит то, что даже другие антивири не видят. Он бесплатен, и поэтому RAR, ZIP и прочие архивы не будут очищены от вирусов.