вот что написано в инструкции на официальном сайте эмулятора PCSX2 "SW rend. threads: Этот чек-бокс доступен, только если выбран режим 'software rendering method'. Здесь вы можете указать, сколько потоков GSdx будет использовать для софтверного рендеринга, чтобы использовать преимущества всех ядер вашего процессора, то есть установите значение 3 для четырех-ядерных процессоров. Значительно увеличивает скорость в много-ядерных системах, при софтверном рендеринге с более чем двумя потоками."
выбор количества потоков, а не количества ядер процессора
можно выставить 16 потоков на двухядерном процессоре и оно будет работать, ограничений нет, если бы количество потоков зависело от количества ядер процессора, то было бы ограничение выбора количества потоков!