Кнопка Fn обрабатывается самой клавой для изменения параметров самой клавы и обычно не выдает сканкод. В случае с ноутбуком, кнопка Fn выдает сканкод, но обработчик прерывания глотает ее, исполняя настройки аппаратуры ноутбука. Самое простое (и оно же сложное) - поменять местами контактную пару и толкатель местами, потребуется токопроводящий лак/клей. Но это реально.