Выяснил что эмуляторы виснут из-за геймпада Genius MaxFire G-08X, когда его отключил то все стало работать нормально. Удалил драйвер геймпада и переустановил, но это не помогло, при его использовании по прежнему эмулятор может зависнуть в любом месте. Пробовал отключать звук в играх тоже не помогает. Геймпад не использует USB, только game-port. В свойствах устройства все кнопки работают нормально.