Короче, я раньше думал, что это глюк имеет место быть только на моем компе, но оказалось не только. Проверял еще на двух - результат один и тот же: если дать тюнапу задание проверить жесткий диск (системный том), то он потребует перезагрузки, а после перезагрузки начне проверять его бесконечное число раз, а именно: как проверка заканчивается, комп перезагружается и проверка начинается заново. Прервать ее нельзя, но можно отменить в течении десяти секунд перед ее началом, но тогда винда загружается и непонятно, что произошло - выполнилась ли проверка как надо и, если да, то где искать результаты этой проверки.