Нехватает различных длл-ок необходимых для запуска эмуля(cg.dll, cgGL.dll, SDL.dll), папки GameIni с конфигурациями для игр, папки Wii с файликами в ней, папки Data с фонами, папки Maps(там один файлик. незнаю для чего он нужен), ну и пустых папок для сохраненок(Data_EUR, Data_JAP, Data_USA, StateSaves).
Если все это дело не изменяется(а я в этом не уверен), то можно из предыдущих версий взять и все. Все, что я перечислил по-любому лежит в исходниках. Поройся в них маленько.