Действительно, другие версии эмулятора работают, к примеру 1.0.3 работает, а версии 1.0.4 r22 и r50 вылетают.
DirectX и С++ переустанавливал, да и у него немного другая проблема была, там вылетало при попытке запустить игру или биос, у меня же вылетает при включении самого эмулятора.
При запуске 1.0.4 r22 выдает ошибку "Unable to load nullpvr_win32.dll plugin , errorlevel=-201" после чего появляется окно настройки плагинов, где в поле графического плагина пусто, нажав ОК или Отмена, вылетает "Unable to load pluginы -- exiting" и на этом конец. Как я понял, он не может загрузить графический плагин и поэтому прекращает работу.
Заменил drkPvr_Win32.dll , взяв из версии r39, теперь работает, всем спасибо!