Если винде много лет, а прог и игр на нее ставили тьму, а жесткий диск старый, полудохлый и с низкой скоростью, то смысл есть.
Прог полно. TuneUp Utilities умеет, например. Есть дефрагментаторы с такой функцией. А вообще, если у тебя 2 винды стоит, то реестр одной свободно дефрагментируется из-под другой.