Бросаем в корневую папку эмулятора необходимые ромы (можно в архивах для меньшего веса, по одному, не кучкой!, zip, rar, без разницы, кроме 7z, его не каждый эмулятор съест), там же создаём файл *bat, в нём (с помощью любого текстового редактора) прописываем следующие строки, к примеру для запуска на NO$GBA рома SilentScope.gba -
start NO$GBA.exe SilentScope.gba
Для других эмуляторов можно попробовать указать путь до рома в строке батника, с NO$GBA это не прокатило. Пример -
start Fusion.exe D:\Emulators\Games\MegaDrive\C\ComixZone.gen
В итоге получаем запуск эмулятора и игры, просто кликнув по батнику. Можно создать ярлык батника и скинуть его на раб. стол, для эстетической красоты сменить значок на более подходящий, допустим скрин или его часть из запускаемой игры ). "Сложность" и муторность такого метода заключается в следующем - для каждой игры необходим свой персональный батник. Пробелы в именах ромов/папок/директорий недопустимы!
На всякий случай прикрепил пустой батник ниже.