alex2014, я понимаю, что описать трудно, но понять заочно ещё труднее :'(
На счет питания мысль интересная, хотя не думаю, что дело в напряжении, всё таки это цифра. Но неудачно разведенные цепи питания, как +5, так GND, могут являться источником помех. К тому же не известно, что представляет из себя этот встроенный усилитель, вполне вероятно, что это обычный инвертор, как в оригинале.
отсутствует какой-то слой
Ну насчет слоя - это громко сказано. Слои формируются таки в PPU, и если его нет - то нет. На самом просто занижена контрастность, поэтому элементы сливаются. Причина да, обычно в выходном каскаде: или его нет или сделан криво. Хотя бывает, что нет первого каскада.