Для начала все-таки советую проверить другой джойстик. У меня как-то было так, что на оригинальном Mega Drive не работали кнопки влево\вправо, при этом, на клоне джойстик работал нормально. Я сначала подумал, что на оригинальном Mega Drive выбило вход для джойстика, и уже было расстроился, но попробовал подключить к оригинальному Mega Drive другой джойстик, и он заработал нормально. Хотя не исключено, что на вашем Mega Drive просто выбит вход для джойстика, тогда все печальнее..