существует ли защита региона на Mega drive 2 приставке ?
Нет. В приставке есть регистр, из которого МОЖНО прочитать биты региона. Но делает это игра. Сама приставка не делает ничего.
На картриджах?
Да. Проверка региона находится именно в картридже. Игра запускается, проверяет регион приставки и далее или работает или нет. И выдаёт сообщение (ну кроме Конами, наверное). Не все игры привязаны к региону. Есть игры, которые привязаны к некоторой комбинации регионов. JE - Азия, JU - 60 Гц. В пиратке бывает вырезана проверка. Но именно проверка, а не сообщение. И если проверки нет, то и регион приставки не имеет значения. Хотя последние годы в пиратку тупо шьют ромы из интернета и не заморачиваются.
если на стороне приставки есть TMSS, то без картриджа она может написать вот так
Не может. Для работы TMSS нужно: а) /CART = low, б)SEGA по адресу $100
Кстати, вся пиратка на оригинальных приставках пишет, что она по лицензии

Исключение составляют насколько самописных тайваньских игр, которые на оригинальных приставках не запускаются..
Вообще причин для не запуска картриджа много. Сам картридж, разводка питания на нём, напряжение питания. В приставке могут быть проблемы. Надо разбираться более досконально и более предметно.