У каждого разные экраны и железо, поэтому и плагины разные. Они не нужны прямо все, может пригодится только один или два, каждый для себя решает.
xBR семейство фильтров, это для замены устаревших 2xSai, Eagle и HQх. Для мультяшной графики, "размыть всё в пластелин".
Много вариантов xBR, это для разного железа. Они примерно все похожи и на 1080p можно даже не увидеть большой разницы. HQх тоже похож, но может меньше уродовать наклонный текст (см. Shining Force), но сильно хуже в играх типо Aladdin.
Eagle и 2xSai устарели и уступают даже HQx, как правило. HQx еще можно пользоваться, он заметно полегче xBRZ и может быть актуальным на каких-то ноутах старых.
xBRZ это более продвинутый вариант xBR, сохраняет больше деталей, но более прожорливый на CPU (в Fusion конкретно, в RetroArch там на шейдерах можно, не напрягая CPU).
Если железо тянет, то 4xBRZ. Если нет, то 2xBR сильно попроще, HQ2x еще проще, а 2xSai и Scale2x то почти на каждом корыте. Это одно болото, но под разным соусом, можно сказать.
Имхо, то из этих всех, то 4xBRZ самый навороченный.
Scale2x это что-то среднее между пластелином и пиксельартом, старается оставить что-то от оригинальной каринки, но условному Mortal Kombat это всё равно не поможет. Тем не менее, достаточно универсальный фильтр. Играм, которые балансируют на грани мультяшности, то может подойти. Например, Battletoads не превращает в пластелин.
Билинейка это обычное мыло, а фильтры типо NTSC это "мыло с дефектами" (не во всех играх работает, потому что разрешение бывает разным в играх Genesis). Остальные прочие фильтры, типо разных lcd3x это имитация экранов. Обычно, работает только для строго определенного разрешения и на большого любителя. Как правило, фильтры старые и заметно уступают популярным шейдерам из RetroArch, вроде zfast_lcd. Вряд ли из них получится что-то годное найти.
Для игр без пиксельарта и где много градиента, вроде Mortal Kombat, Batman Forever и прочих Zero Tolerance, то там только разные фильтры на размытие помогут. На Fusion нормальных даже и нету таких, как по мне. NTSC-фильтр и билинейку пробовать, может.
Все на любителя, в общем. Но, если есть xBRZ, то можно обойтись без всех похожих и оставить только аля scale2/4x, может hq2/4х и ntsc blargg.