dgVoodoo2 помогает от такого.
Положи файл .\MS\x86\DDraw.dll и dgVoodooCpl.exe (из архива dgVoodoo2_81_3) рядом к Fusion.exe.
dgVoodoo2 найдешь где скачать, легко гуглится.
Правда, в полноэкранном режииме не будет работать всплывающее меню по правому клику мышой.
Насколько это целесообразно, не знаю. В плане того, что проще использовать другой эмулятор, если Fusion не работает как надо. Он ведь довольно старый и на новых системах багует. Лучше всего работал на WinXP, но потом пошли несовместимости, а автор эмуль забросил обновлять и исходников никому не дал, что бы пофиксили.
Попробуй Regen v0.97, как вариант. Внешне очень сильно похож на Fusion, правда без Sega CD и 32х, вроде. По звуку даже лучше.
--------------
Еще можно пробовать в настройках драйвера видеокарты, переключить скейлинг на GPU и включить сохранение пропорций.
Это где-то в Display->Adjust desktop size and position->2.Apply the following settings: Aspect ratio; Perform scaling on: GPU ->нажать Apply.
Зависит от видеокарты. На портативных Nvidia примерно так