А при чём тут 3Д

? Game Maker совсем не 3Д, просто там фича такая появилась, с версии 6, а так вобщем-то чистое 2Д.
Насчёт Klik & Play, она была создана для возможности в 5 минут создать простенький платформер, и с этой целью она справилась превосходно, но накрутить на простенький платформер в ней что-либо практически невозможно, ан а Game Maker`е если сильно расстараться можно сделать РПГ.