Ну дык, программатор же не только шьет, он еще и считывать умеет. Сравнишь прошивку микроконтроллера с исходным файлом и все. Если все-таки соберешься собрать программатор, то не забудь выключить буфера FIFO для COM-портов (если программатор под COM), это делается в диспетчере устройств, а то я 3 программатора на макетке собрал, и все думал что у меня руки кривые, т.к. работать не хотели.
Ну и вообще, в консоль можно запаять DIP-8 колодку (стоит примерно 5р), а в нее вставить микроконтроллер, места в консоли должно хватить под это дело, да и сам микроконтроллер паять не прийдется.
