Если бы мне всё было понятно, я бы вопросов не задавал.
Взяли глаза в руки и смотрим: нижний вывод кварца соединен только с CX1, верхний с обратной стороны тянется к верхней перемычке на S3.
Кодер кошерный - Sony CXA1145M
J14 размыкает дорожку между MC68K и MD270
JP3 замкнут, через R61 идет к MC68K, но контакта с MD270 нет - там нет ноги
JP3 С транзистором вроде как не связан, если мне зрение не изменяет.
Схемки попозже приложу.