Лучше виндовой тулзы.
Да лишнее это, ИМХО. Форматируй виндовой полным форматированием (тогда будет проверка на беды). Или быстрым, а потом проверь Victoria (под виндой или DOS) с ремапом плохих секторов.
Если хочешь данные затереть или ещё что-то по-хитрому, то та же Victoria, MHDD, дистрибутивы Linux. Со всем этим придется разбираться, если не пользовался раньше.
Формать полным виндовым и не парься, если винт нормальный - оно сделает свою работу не хуже (или даже лучше) других
